Estudio QSAR de inhibidores de trombina como función del tiempo

Abstract

Los seres vivos utilizan frecuentemente una serie de reacciones enzimáticas en cadena como respuesta a un estímulo externo y/o interno, un ejemplo de esto es la formación de coágulos sanguíneos en el interior de un vaso sanguíneo (trombosis), que dependiendo de su ubicación puede generar diferentes afecciones y complicaciones de salud. Actualmente existen diferentes medicamentos en el mercado para evitar y/o contrarrestar la formación de los trombos; sin embargo, presentan diferentes efectos secundarios. Una solución ha sido la investigación de compuestos alternativos, como los heterocíclicos no peptídicos derivados del benzimidazol que presentan efecto inhibitorio sobre la trombina. La trombina presenta diferentes cavidades, conocidas por D- y P-cavidad, con tres principales sitios activos, S1 a S3, siendo el sitio S1 el principal, el cual se encuentra ubicado cercano al aminoácido Serina 195 [1]. Conocer el sitio de inhibición sobre esta enzima, la forma en que interactúa y los cambios conformacionales que sufre con el tiempo por medio de las diferentes herramientas computacionales han permitido predecir la actividad de nuevas moléculas; entre ellas el análisis QSAR por medio de regresiones multilineales, regresiones no lineales vía redes neuronales artificiales y simulaciones moleculares a partir del reconocimiento molecular (Docking), que describan las interacciones entre la trombina y sus inhibidores. Algunos de los cuales, presentan efectos no deseados como la falta de selectividad, baja bio-disponibilidad oral y que poseen grupos funcionales reactivos como aldehídos, cetonas y ácidos borónicos, entre otros [2].