Identificación de las frecuencias alélicas A1 y A2 del gen CSN2 en bovinos de la región del Papaloapan, mediante qPCR.

Abstract

En el presente estudio, se identificaron los alelos A1 y A2 del gen CSN2, responsable de la producción de β-CN, en hembras bovinas, en estado lactante, de doble propósito de la región del Papaloapan. Se analizaron muestras sanguíneas provenientes de 142 animales a las cuales se extrajo el ADN, este fue cuantificado y se obtuvieron alícuotas a una concentración de 5 ng/µL. Mediante un análisis bioinformático, se identificó la secuencia donde se encuentra el polimorfismo de la posición 8108 del gen CSN2 y se diseñaron oligonucleótidos específicos para su amplificación mediante qPCR, así como controles sintéticos con el cambio de base perteneciente a cada alelo a identificar. Se realizó la amplificación por qPCR en el equipo PikoReal24™ y el análisis de curvas de disociación de alta resolución mediante el PikoReal Software 2.2 y la herramienta HRM. Las frecuencias genotípicas obtenidas fueron de 0.317, 0.282 y 0.401 para los homocigotos A1A1, A2A2 y el heterocigoto A1A2 respectivamente. Las frecuencias alélicas calculadas fueron de 0.5176 y 0.4824 para los alelos A1 y A2 respectivamente. Mediante el estadístico de χ2 se obtuvo un valor de 5.4787 con 1 un grado de libertad y un α= 0.05, determinando que la población no se encuentra en equilibrio de HardyWeinberg.